A pesar de que entre los vertebrados el grupo más representado en la isla son las aves, existen dos especies de reptiles que es necesario mencionar por su importancia: el lagarto Atlántico (Gallotia atlantica) y el perenquén majorero (Tarentola angustimentalis), ambos endémicos. El primero de ellos es, sin duda, la especie más interesante por haber experimentado un notable grado de diferenciación subespecífica. Sin embargo, en el caso del perenquén su importancia radica en ser un gecónido exclusivo de las islas orientales.
En Lanzarote existen 34 especies de aves nidificantes, al margen de las aves migratorias que visitan la isla. Destaca la Hubara Canaria (Chlamydotis undulata fuerteventurae) entre las nidificantes, siendo ésta. una especie endémica de Fuerteventura y Lanzarote, y encontrándose en esta última isla la mitad de su población.otasr especies presentes en este peculiar hábitat son el escaso corredor (Corsorius curspr) y el álcavarán (Burhinus oedicnemus).
El mayor atractivo ornitológico se encuentra en el Parque Natural de los Islotes y Riscos de Famara que es una zona ZEPA (Zona de Especial Protección para las Aves). Destacan las aves marinas, de las que habitan un total de siete especies; por su abundancia hay que mencionar a la Pardela Cenicienta (Calonectris diomedea), que en Alegranza mantiene la mayor colonia de todo el territorio nacional, con unas 8.000 parejas reproductoras (Martín et al., 1991).
Por su rareza hay que citar el pequeño núcleo reproductor del Paíño Pechialbo (Pelagodroma marina) en Montaña Clara, que representa el único punto de cría de todo el archipiélago. En este privilegiado espacio natural nidifican además importantes contingentes del Paíño Común (Hydrobates pelagicus), Petrel de Bulwer (Bulweria bulwerii) y Paíño de Madeira (Oceanodroma castro), as como varias rapaces, caso del Alimoche (Neophron percnopterus), el Aguila Pescadora (Pandion haliaetus), además de importantes efectivos del Halcón de Berbería (Falco pelegrinoides),y la totalidad de la población insular, unas 10 parejas, del Halcón de Eleonor (Falco eleonorae), especie amenazada a escala mundial.
Existen otras zonas de gran interés ornitológico como son: el Parque Nacional de Timanfaya, el Macizo de los Ajaches, los llanos del Rubicón, de gran importancia para la Hubara Canaria y el Corredor, y el Barranco de Teneguime, donde nidifican la Lechuza (Tyto alba) y el Alimoche (Neophron percnopterus ).
La mayoría de los mamíferos de la isla son introducidos con excepción de la Musaraña Canaria ( Crocidura canariensis). A pesar de estar ampliamente distribuida en todo el territorio insular, la población más importante se concentra en Montaña Clara, debido ala ausencia del Ratón Casero (Mus musculus), micromamífero que representa un serio competidor para la musaraña.